Nøjagtig identifikation af arter er grundlæggende ikke kun for sygdomshåndtering, men også for implementering af reguleringsforanstaltninger for at forhindre patogenspredning. I betragtning af den hurtige stigning i international handel er hurtige reaktioner baseret på nøjagtig patogenidentifikation afgørende for at beskytte landbruget og naturlige økosystemer mod spredningen af ødelæggende sygdomme. Et af de mest udfordrende aspekter ved at arbejde med Phytophthora-arter er at identificere dem korrekt; det kræver omfattende træning og erfaring. Mange diagnostiske laboratorier, både i USA og rundt om i verden, mangler denne type træning og vil ofte kun identificere ukendte kulturer på slægtsniveau. Dette kan utilsigtet tillade arter af bekymring at slippe igennem uopdaget. Artskomplekser gør molekylær identifikation af arter og implementering af diagnostiske systemer meget vanskelig. Desuden er mange DNA-sekvenser fra forkert identificerede Phytophthora-prøver tilgængelige i offentlige databaser såsom NCBI. At have sekvenser fra typeprøverne er afgørende for nøjagtig molekylær identifikation af arter i slægten.
IDphy blev udviklet for at lette nøjagtig og effektiv identifikation af arter for slægten ved at bruge typeprøverne fra de originale beskrivelser, hvor det er muligt. IDphy er nyttigt for forskere over hele verden, især dem, der arbejder med diagnostik og reguleringsprogrammer. IDphy lægger vægt på arter med høj økonomisk betydning og arter af regulatorisk bekymring for U.S.A.
Forfattere: Z. Gloria Abad, Treena Burgess, John C. Bienapfl, Amanda J. Redford, Michael Coffey og Leandra Knight
Originalkilde: Denne nøgle er en del af det komplette IDPhy-værktøj på https://idtools.org/id/phytophthora (kræver internetforbindelse). Eksterne links er angivet i faktaarkene for nemheds skyld, men de kræver også en internetforbindelse. Det fulde IDphy-websted indeholder også SOP'er og strategier til at opnå et højere niveau af tillid til molekylær bestemmelse af ukendte arter, en tabelnøgle; morfologi og livscyklusdiagrammer samt vækst-, opbevarings- og sporulationsprotokoller; og en detaljeret ordliste.
Denne Lucid Mobile nøgle blev udviklet i samarbejde med USDA APHIS Identification Technology Program (USDA-APHIS-ITP). Besøg https://idtools.org for at lære mere.
Denne app er drevet af LucidMobile. Besøg https://www.lucidcentral.org for at lære mere.
Mobilapp opdateret: august 2024