IDphy

Une identification précise des espèces est fondamentale non seulement pour la gestion des maladies, mais également pour la mise en œuvre de mesures réglementaires visant à prévenir la propagation des agents pathogènes. Compte tenu de l’augmentation rapide du commerce international, des réponses rapides basées sur une identification précise des agents pathogènes sont essentielles pour protéger l’agriculture et les écosystèmes naturels de la propagation de maladies dévastatrices. L’un des aspects les plus difficiles du travail avec les espèces de Phytophthora est de les identifier correctement ; cela nécessite une formation et une expérience approfondies. De nombreux laboratoires de diagnostic, tant aux États-Unis que dans le monde, ne disposent pas de ce type de formation et identifient souvent uniquement les cultures inconnues au niveau du genre. Cela pourrait par inadvertance permettre à des espèces préoccupantes de passer sans être détectées. Les complexes d’espèces rendent très difficiles l’identification moléculaire des espèces et la mise en œuvre de systèmes de diagnostic. En outre, de nombreuses séquences d'ADN provenant de spécimens de Phytophthora mal identifiés sont disponibles dans des bases de données publiques telles que NCBI. Avoir des séquences des spécimens types est essentiel pour une identification moléculaire précise des espèces du genre.

IDphy a été développé pour faciliter une identification précise et efficace des espèces du genre, en utilisant autant que possible les spécimens types des descriptions originales. IDphy est utile aux scientifiques du monde entier, en particulier à ceux travaillant dans les programmes de diagnostic et de réglementation. IDphy met l'accent sur les espèces à fort impact économique et sur les espèces qui suscitent des préoccupations réglementaires pour les États-Unis.

Auteurs : Z. Gloria Abad, Treena Burgess, John C. Bienapfl, Amanda J. Redford, Michael Coffey et Leandra Knight

Source originale : cette clé fait partie de l'outil IDPhy complet sur https://idtools.org/id/phytophthora (nécessite une connexion Internet). Des liens externes sont fournis dans les fiches d’information pour plus de commodité, mais ils nécessitent également une connexion Internet. Le site Web complet d'IDphy comprend également des SOP et des stratégies permettant d'obtenir un niveau de confiance plus élevé dans la détermination moléculaire d'espèces inconnues, une clé tabulaire ; diagrammes de morphologie et de cycle de vie ainsi que protocoles de croissance, de stockage et de sporulation ; et un glossaire détaillé.

Cette clé Lucid Mobile a été développée en coopération avec le programme de technologie d'identification USDA APHIS (USDA-APHIS-ITP). Veuillez visiter https://idtools.org pour en savoir plus.

Cette application est alimentée par LucidMobile. Veuillez visiter https://www.lucidcentral.org pour en savoir plus.

Application mobile mise à jour : août 2024