A főszereplő a félmechanikus Froggy béka, akit egy őrült tudós hozott létre. A játékos feladata, hogy színes golyókat helyezzen el különféle tárgyakban (amelyek a világon nagyon eltérőek). Óvatosan kell elkapnod őket, hogy ne veszítsd el a pontokat és Froggy életét. Ennek köszönhetően Froggy megszökik a laboratóriumból, és megmentheti barátait. A kaland során a játékos különféle világokat fog felfedezni: a laboratóriumot, a víz alatti biomot, a kút belsejét, a trópusi dzsungelt, az eget és a jeges hegyeket. Mindegyiknek megvan a maga egyedi mechanikája. Addig is összegyűjti azokat a részeket, amelyek egy hajó építéséhez szükségesek az űrbe jutáshoz!