IDphy

Nauwkeurige identificatie van soorten is niet alleen van fundamenteel belang voor ziektebeheer, maar ook voor de implementatie van regelgevende maatregelen om de verspreiding van ziekteverwekkers te voorkomen. Gezien de snelle toename van de internationale handel zijn snelle reacties op basis van nauwkeurige identificatie van ziekteverwekkers van cruciaal belang voor de bescherming van de landbouw en natuurlijke ecosystemen tegen de verspreiding van verwoestende ziekten. Een van de meest uitdagende aspecten van het werken met Phytophthora-soorten is het correct identificeren ervan; het vereist uitgebreide training en ervaring. Veel diagnostische laboratoria, zowel in de VS als over de hele wereld, missen dit soort training en zullen vaak alleen onbekende culturen tot op geslachtsniveau identificeren. Hierdoor kunnen zorgwekkende soorten onbedoeld onopgemerkt doorglippen. Soortencomplexen maken de moleculaire identificatie van soorten en de implementatie van diagnostische systemen erg moeilijk. Bovendien zijn veel DNA-sequenties van onjuist geïdentificeerde Phytophthora-specimens beschikbaar in openbare databases zoals NCBI. Het hebben van sequenties van de typespecimens is essentieel voor nauwkeurige moleculaire identificatie van soorten in het geslacht.

IDphy is ontwikkeld om nauwkeurige en efficiënte identificatie van soorten voor het geslacht mogelijk te maken, waarbij waar mogelijk gebruik wordt gemaakt van de type-exemplaren uit de originele beschrijvingen. IDphy is nuttig voor wetenschappers over de hele wereld, vooral degenen die werkzaam zijn in diagnostiek- en regelgevingsprogramma's. IDphy legt de nadruk op soorten met een grote economische impact en soorten die aanleiding geven tot zorg voor de VS.

Auteurs: Z. Gloria Abad, Treena Burgess, John C. Bienapfl, Amanda J. Redford, Michael Coffey en Leandra Knight

Originele bron: Deze sleutel maakt deel uit van de volledige IDPhy-tool op https://idtools.org/id/phytophthora (internetverbinding vereist). Voor het gemak zijn externe links opgenomen in de factsheets, maar hiervoor is ook een internetverbinding vereist. De volledige IDphy-website bevat ook SOP's en strategieën om een ​​hoger niveau van vertrouwen te verkrijgen in de moleculaire bepaling van onbekende soorten, een tabellarische sleutel; morfologie- en levenscyclusdiagrammen, evenals protocollen voor groei, opslag en sporulatie; en een gedetailleerde woordenlijst.

Deze Lucid Mobile-sleutel is ontwikkeld in samenwerking met het USDA APHIS Identification Technology Program (USDA-APHIS-ITP). Bezoek https://idtools.org voor meer informatie.

Deze app wordt mogelijk gemaakt door LucidMobile. Bezoek https://www.lucidcentral.org voor meer informatie.

Mobiele app bijgewerkt: augustus 2024