Et nøkkelelement i ethvert robotsystem er programmeringsprogramvaren. ENGINO® har utviklet en spesiell programvare, KEIRO, som er en blokkbasert programmeringsplattform som tillater ulike programmeringsmetoder avhengig av brukerens behov og evner.
Roboten kan også programmeres manuelt med knappene på bordet. Programvaren brukes til å redigere programmet og legge til komplisert funksjonalitet ved bruk av et brukervennlig flytdiagramgrensesnitt.