Het is gebruikelijk om te spreken van een hele bacteriesoort als pathogeen wanneer het wordt geïdentificeerd als de oorzaak van een ziekte. De moderne opvatting is echter dat pathogeniteit afhangt van het microbiële ecosysteem als geheel. Een bacterie kan deelnemen aan opportunistische infecties bij immuungecompromitteerde gastheren, virulentiefactoren verwerven door plasmide-infectie, overgebracht worden naar een andere plaats binnen de gastheer of reageren op veranderingen in het totale aantal andere aanwezige bacteriën. Zo kan infectie van mesenteriale lymfeklieren van muizen met Yersinia de weg vrijmaken voor voortdurende infectie van deze plaatsen door Lactobacillus, mogelijk door een mechanisme van "immunologische littekens". Inhoud van dit boek: Pathogeen, Pathogeniteit, Soorten pathogenen, Pathogeengastheren, Behandeling, Seksuele interacties, Prion, Prion-eiwit, Prion-replicatie, Ziekten, Schimmels, Behandelingen, Bij andere ziekten, Etymologie en uitspraak, Virus, Etymologie, Oorsprong en vroeg evolutie, morfologie, celstructuur, metabolisme, groei en reproductie, genetica, gedrag, classificatie en identificatie, interacties met andere organismen, betekenis in technologie en industrie, pathogene bacteriën, ziekten, mechanismen van schade, overleving in gastheer, identificatie, behandeling, preventie Lijst van kenmerken van geslachten en microscopie, Lijst van soorten en klinische kenmerken, Genetische transformatie, Schimmel, Kenmerken, Diversiteit, Mycologie, Morfologie, Groei en fysiologie, Reproductie, Evolutie, taxonomie, ecologie, mycotoxinen, pathogene mechanismen, menselijk gebruik, pathogene schimmel, Candida, Aspergillus, Cryptococcus, Histoplasma, Pneumocystis, Stachybotrys, afweermechanismen van de gastheer, menselijke parasiet, meest voorkomende parasieten, algemeen gedocumenteerde parasieten, protozoa, kenmerken, classificatie, ecologie, parasitaire worm, taxonomie, reproductie en levenscyclus, Gebruik in de geneeskunde