"Kybalion" to dzieło, które wzbudziło pewną tajemnicę co do jego autorstwa. Chociaż książka jest przypisywana Trzem Wtajemniczonym, nie podano żadnych konkretnych imion. Spekuluje się, że skupienie się na anonimowości może wynikać z ezoterycznej natury nauk przedstawionych w dziele. Niektórzy uważają, że Trzej Wtajemniczeni mogą być grupą osób zaznajomionych z naukami hermetycznymi, które zdecydowały się zachować swoją tożsamość w tajemnicy.
Przez lata pojawiały się różne teorie na temat tego, kim mogą być prawdziwi autorzy książki. Niektórzy sugerują, że postacie takie jak William Walker Atkinson, płodny pisarz na temat metafizyki i okultyzmu, mogły być zaangażowane w tworzenie Kybalionu, choć nie jest to potwierdzone. Inni teoretyzują, że książka może być wynikiem kompilacji i reinterpretacji starożytnych nauk hermetycznych przez grupę uczonych.
Krótko mówiąc, dokładna tożsamość autorów "Kybalionu" pozostaje w dużej mierze tajemnicą, dodając aury intrygi i mistycyzmu temu duchowo wpływowemu dziełu.